L'offre que vous souhaitez consulter n'est plus valide.
Ce poste a été pourvu.


STAGE - Ingénieur(e) Recherche bioinformatique (H/F)



Référence : 515920_1603884922
Date de dépot : 28/10/2020
Entreprise : DASSAULT SYSTEMES

Descriptif
Description : Imaginez demain...

L'organisation "Healthcare & Life Sciences Research" de Dassault Systèmes est une équipe pluridisciplinaire dans des domaines technologiques, biologiques et biomédicaux de l'entreprise. Elle réalise une veille scientifique et technologique permanente et réalise des prototypes logiciels pour évaluer l'applicabilité des nouvelles technologies et des connaissances scientifiques pour une nouvelle dimension de la santé humaine. Par exemple, dans un but de prévention, la modélisation virtuelle et sa simulation vont devenir un élément clef pour les médecins qui peuvent transformer des informations très complexes en actes médicales pratiques.

Savez-vous ce que c'est le microbiote humain ? joue-t-il un rôle essentiel chez l'homme ? Avez-vous envie d'explorer son monde et ses interactions avec notre corps, à travers la modélisation mathématique ?

Au sein de l'équipe « Living Therapeutics », nous travaillons sur des technologies d'analyse et de modélisation de ces interactions microbiote-hôte. Nous souhaitons explorer une nouvelle approche de modélisation capable d'intégrer des réseaux métaboliques avec des contraintes physiologiques et anatomiques. Le tout en intégrant des données physiologiques et du nutriment, et en les analysons à l'aide de méthodologies comme la Flux Balance Analysis.

Pourquoi des réseaux métaboliques ? Parce que le microbiote joue un rôle vital dans le métabolisme des nutriments et la production de métabolites divers et variés. Ces derniers ont une grande influence sur notre état de santé, jusqu'à nous protéger de certaines maladies ou au contraire participer à leur survenue ou à leur progression. C'est tout le défi de la recherche clinique des prochaines années.


Vos futurs défis

Au sein du stage, vous vous familiariserez d'abord avec les travaux antérieurs, la modélisation de réseaux métaboliques et l'avancement des recherches académiques, ensuite vous explorerez cette nouvelle approche en partant du systèmes digestive et sa composante microbienne. Le travail de méthodologie sera accompagné par l'implémentation d'un prototype du modèle virtuel, suivi par une phase d'interprétation des résultats obtenus et une phase de défi de son comportement pour augmenter notre compréhension du fonctionnement humain.

Keywords: bioinformatique, modélisation de systèmes biologiques, physiologie, réseaux métaboliques, programmation linéaire


Références :
* Ines Thiele, Swagatika Sahoo, Personalized whole-body models integrate metabolism, physiology, and the gut microbiote. Molecular systems biology. (2020)
* Heinken, A., Ravcheev, D.A., Baldini, F. et al, Systematic assessment of secondary bile acid metabolism in gut microbes reveals distinct metabolic capabilities in inflammatory bowel diseases. Microbiome (2019)
* Gottstein et al. Constraint-based stoichiometric modelling from single organisms to microbial communities. J R Soc Interface. 2016 Nov; 13(124).
* Orth JD et al. What is flux balance analysis?, 2010, Nat. Biotechnol. 28, 245-248.


Profil recherché
Profil recherché : Vous atouts pour réussir


* De bonnes connaissance en Modélisation mathématique et statistique
* Excellent niveau de programmation Python
* De bonnes notions en Linear programming


Votre candidature aura un atout supplémentaire, si vous avez :


* Des connaissances de base en biologie
* Travaillé sur la modélisation & analyse de réseaux métaboliques
* Travaillé avec des données biologiques
* Créativité et esprit collaboratif dans l'échange d'idées avec les autres membres du département Healthcare & Life Sciences Research.
* Autonomie et force de propositions pour la mise en œuvre du prototype
* Rigueur et autonomie dans votre conduite technique du stage.

Niveau d'étude : Bac + 5 et plus : DEA, DESS, mastère, MBA...
Lieu de la mission : Île-de-France - Vélizy-Villacoublay
Poste(s) disponible(s) : 1
Poste de cadre : Suivant Profil
Contrat : Stage
Durée du contrat : 6 mois
Début de la mission : 02/01/2021

Entreprise
Nom de l'entreprise : DASSAULT SYSTEMES
Site Web : https://careers.3ds.com/
Contact : Madame Hulot Céline
Adresse : 10 Rue Marcel Dassault
78140 Vélizy-Villacoublay
France



L'offre que vous souhaitez consulter n'est plus valide.
Ce poste a été pourvu.